Das Fach Physik wird in der Sekundarstufe I in den Jahrgangsstufen 5, 7, 8 und 9 unterrichtet. In der Oberstufe ist Physik am Ceciliengymnasium in Grund- und Leistungskursen fest etabliert.

Der Kern des Physikunterrichts ist immer die Naturbeobachtung. Schülerinnen und Schüler erfahren Alltagsphänomene mit allen Sinnen (Lernen mit Kopf, Herz und Hand). Hieraus ergeben sich Fragestellungen, die in eigenen Experimenten genauer untersucht werden. So werden zum Beispiel in der Jgst. 5 Thermometer selbst entwickelt, in Jgst. 7 Lochkameras gebaut und erforscht, in Jgst. 8 werden Brückenmodelle konstruiert und genauer unter die Lupe genommen und in Jgst. 9 Elektromotoren hergestellt.