Das Fach Physik wird in der Sekundarstufe I in den Jahrgangsstufen 6, 8, 9 und 10 unterrichtet. In der Oberstufe ist Physik am Ceciliengymnasium in Grund- und Leistungskursen fest etabliert.
Der Kern des Physikunterrichts ist immer die Naturbeobachtung. Schülerinnen und Schüler erfahren Alltagsphänomene mit allen Sinnen (Lernen mit Kopf, Herz und Hand). Hieraus ergeben sich Fragestellungen, die in eigenen Experimenten genauer untersucht werden. So werden zum Beispiel in der Jgst. 6 Thermometer selbst entwickelt, Magnetkompasse hergestellt, elektrische Sicherungen untersucht und Stromkreise erforscht, in Jgst. 8 Linsen getestet und Lochkameras und Teleskope gebaut, in Jgst. 9 werden astronomische Beobachtungen gedeutet, Brückenmodelle konstruiert und genauer unter die Lupe genommen und in Jgst. 10 Elektromotoren hergestellt und mit verschiedenen anderen Motortypen verglichen.